Sosyal Bilimler Enstitüsü, 29/05/2007 tarih ve 5662 sayılı Resmî Gazete’de yayımlanan 41 Sayılı Kanun Hükmünde Kararnamenin 25. Maddesinin "e" bendine göre, Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi Rektörlüğüne bağlı olarak kurulmuştur. Enstitümüz ilk lisansüstü eğitim-öğretim faaliyetine Şubat 2008’de İşletme ve Kamu Yönetimi Anabilim Dallarında başlamıştır.
Sosyal Bilimler Enstitüsü, İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi Binası’nda 300 m2'lik kapalı alanda hizmet vermektedir. Halen Enstitü bünyesinde 28 Anabilim Dalında Tezli Yüksek Lisans Programı, 19 Anabilim Dalında Tezsiz Yüksek Lisans programı,10 Anabilim Dalında ise Doktora programı açık olup, 2024-2025 eğitim-öğretim yılı güz yarıyılı itibariyle 1028 Tezli Yüksek Lisans, 625 Tezsiz Yüksek Lisans (İkinci Öğretim) ve 84 doktora programı öğrencisi eğitimine devam etmektedir. Kuruluşundan günümüze kadar lisansüstü programlarımızdan 850 tezli yüksek lisans, 1875 Tezsiz Yüksek Lisans (İkinci Öğretim) ve 26 doktora öğrencisi mezun olmuştur.